稀有精灵的分布往往与特定地点和任务条件紧密相关。急冻鸟位于双子岛最深处，需要将岩石推入洞中阻挡水流才能遇见；闪电鸟藏身于无人发电厂内部；火焰鸟则栖息在灯火山顶部。超梦作为传说级精灵，需在华蓝洞窟最底层挑战，而梦幻的捕捉则需要获得特殊钥匙后前往红莲岛附近的小屋。这些精灵的出现通常需要玩家完成主线剧情或解谜任务，部分甚至需借助秘传技能如冲浪、怪力等才能抵达其所在地。
除传说精灵外，部分常规稀有精灵也有固定出没区域。常磐森林可遇到妙蛙种子，华蓝市左侧草地有小火龙，而化石精灵如化石盔和菊石兽需在月见山深处击败火箭队后二选一复活。狩猎区独有的袋龙、迷你龙等需使用沙狐球捕捉。幽灵塔顶层的幽灵系精灵需先获得观测镜才能显形并捕捉，而紫苑镇灵塔的精灵则需完成火箭队相关剧情后解锁。
捕捉策略上，降低目标HP至红色状态并施加睡眠或麻痹效果能显著提升成功率。大师球建议保留给超梦或三神鸟，其他稀有精灵可尝试用高级球或超级球配合状态技能。岩山隧道、冠军之路等复杂地形中的稀有精灵如铁甲犀牛、卡比兽等，需提前准备闪光术和碎石术以畅通路径。部分精灵如吉利蛋仅在特定时间段出现，需反复探索才能遭遇。
后期探索中，七岛区域隐藏着更多稀有精灵。三号岛左侧森林有雪拉比，七号岛海底通过潜水可发现红蓝水都，一号岛火焰山地下存在古拉顿。这些精灵的捕捉往往需要全国图鉴升级后的触发条件，且部分需完成二周目任务如修复机器、收集红蓝宝石等。建议携带高等级队伍并备足回复道具，以应对高强度战斗。
稀有精灵的获取是游戏进程与探索技巧的结合。合理规划路线、善用道具和技能，并耐心应对随机遭遇机制，是完成全图鉴收集的关键。部分精灵的隐藏条件需通过NPC对话或环境互动触发，建议玩家在关键区域仔细调查以避免遗漏。
